Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C11orf49Q9H6J7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C11orf49Q9H6J7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms