Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP3Q9H4L4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP3Q9H4L4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP3Q9H4L4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP3Q9H4L4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP3Q9H4L4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP3Q9H4L4 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SENP3Q9H4L4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SENP3Q9H4L4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SENP3Q9H4L4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms