Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN2Q9H4D0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN2Q9H4D0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms