Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SIK2Q9H0K1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIK2Q9H0K1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms