Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC113Q9H0I3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC113Q9H0I3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms