Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF3Q9H094 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF3Q9H094 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms