Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GFRA4Q9GZZ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GFRA4Q9GZZ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms