Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NYXQ9GZU5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NYXQ9GZU5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NYXQ9GZU5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms