Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CIPCQ9C0C6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CIPCQ9C0C6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIPCQ9C0C6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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