Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM6SF1Q9BZW5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TM6SF1Q9BZW5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM6SF1Q9BZW5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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