Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CPEB1Q9BZB8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CPEB1Q9BZB8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms