Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PCGF6Q9BYE7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PCGF6Q9BYE7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PCGF6Q9BYE7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms