Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC3Q9BY71 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC3Q9BY71 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms