Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HDAC8Q9BY41 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HDAC8Q9BY41 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms