Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC4A5Q9BY07 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A5Q9BY07 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms