Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C1QTNF4Q9BXJ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C1QTNF4Q9BXJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms