Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSM14BQ9BX40 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSM14BQ9BX40 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms