Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC94Q9BW85 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms