Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CINPQ9BW66 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CINPQ9BW66 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms