Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM2Q9BVW6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM2Q9BVW6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 348.4 ms