Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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CHCHD7Q9BUK0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHCHD7Q9BUK0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHCHD7Q9BUK0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHCHD7Q9BUK0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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