Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB6Q9BUF5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms