Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PCGF1Q9BSM1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCGF1Q9BSM1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms