Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM175Q9BSA9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM175Q9BSA9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms