Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP44Q9BS26 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP44Q9BS26 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms