Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC50A1Q9BRV3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC50A1Q9BRV3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms