Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CPPED1Q9BRF8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CPPED1Q9BRF8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms