Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPIN3Q9BQK8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPIN3Q9BQK8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms