Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CMSS1Q9BQ75 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms