Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TREX2Q9BQ50 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms