Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5SQ99766 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms