Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCA3Q99758 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ABCA3Q99758 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ABCA3Q99758 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms