Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDX2Q99626 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDX2Q99626 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms