Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUP88Q99567 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUP88Q99567 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUP88Q99567 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms