Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMS19Q96T76 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMS19Q96T76 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms