Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCT8L2Q96SF2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8L2Q96SF2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms