Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALS2Q96Q42 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALS2Q96Q42 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms