Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms