Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RUNDC3BQ96NL0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RUNDC3BQ96NL0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC3BQ96NL0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms