Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF558Q96NG5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF558Q96NG5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms