Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP44Q96MT7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP44Q96MT7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms