Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCMTD1Q96MG8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCMTD1Q96MG8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms