Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C8orf48Q96LL4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf48Q96LL4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms