Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DCHS1Q96JQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DCHS1Q96JQ0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms