Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ZBED3Q96IU2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZBED3Q96IU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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