Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IMP4Q96G21 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IMP4Q96G21 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms