Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RNFT2Q96EX2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RNFT2Q96EX2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms