Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TVP23CQ96ET8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TVP23CQ96ET8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms