Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG4CQ96DT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms