Protein–RNA interactions for Protein: Q92747

ARPC1A, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1AQ92747 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARPC1AQ92747 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1AQ92747 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms